English

瑞雪丰年,捷报频传!真固生物在2017年全国肿瘤体细胞基因突变高通量测序检测生物信息学分析室间质评100分通过!

日期:2018-01-25 11:30:03分享到

为了解我国肿瘤体细胞基因突变高通量测序检测实验室生物信息学分析能力的现状,卫生部临床检验中心2017年10月30日至12月28日开展了该项目室间质量评价的调查活动。本次质评包括第一次质评调查、实验室错误原因分析和第二次质评调查三个阶段。

本次质评是对实验室进行肿瘤体细胞基因突变高通量测序检测生物信息学分析能力的评价。生物信息分析包括原始数据的质量控制、数据比对、数据比对后处理、变异识别、变异注释以及变异过滤等步骤。不同的高通量测序平台,产生的测序数据类型有一定的差别,因此本次室间质评样本包括Illumina、Ion torrent和BGISeq500三种测序文件。

本次质评总计有136家实验室回报质评结果,收到结果136份,其中有效结果113份。进行Illumina测序文件、Ion torrent测序文件和BGISeq500测序文件分析的实验室百分比分别为70.8%(80/113)、24.8%(28/113)和4.43%(5/113)。在对多数的书写错误不计分的情况下,第一次室间质评调查总的合格率为34.5%( 39/113 ),第二次质评调查的成绩有所提高,总的合格率为65.5%(74/113),全部正确的实验室49.6%(56/113),仍有5.3%(6/113)的实验室为0分。进行Illumina测序文件、Ion torrent测序文件和BGISeq500测序文件分析的实验室符合率分别仅为62.5%(50/80)、71.4%(20/28)和80%(4/5),全部正确的实验室仅分别为42.5%(34/80)、64.3%(18/28)和80.0%(4/5)。

真固生物参加本次室间质评依靠自主研发的生物信息分析软件(PiVAT)获得100分,充分证明了自身生物信息分析能力和PiVAT分析性能的可靠性。PiVAT,智能化生物信息分析系统,全web界面操作,一步完成从测序原始数据(bcl或fastq文件)到突变列表的全部分析工作。

图片关键词

 

分享到:
点击次数:  更新时间:2018-01-25