泛癌种56基因检测Panel
本panel基于SLIMamp®专利技术(专利号:ZL 2016 8 0001111.1)进行建库,检测56个实体瘤相关基因的热点区域,可以检测SNVs和indels变异,平均扩增子长度143bp,覆盖区域总长度25kb。具有操作时间短,靶序列中靶率、比对率和特异性高的特点。可用于临床实体瘤的分子分型和靶向药物用药指导。
Panel 优势
最低仅需2.5ngDNA即可完成建库
目标区域覆盖超过7200个实体瘤热点突变
最低可检测低至1%的体细胞突变
整个文库构建流程仅需5小时(操作时间低至2小时)
基因列表
ABL1 | CSF1R | FGFR1 | HNF1A | KRAS | NTRK1 | ROS1 |
AKT1 | CTNNB1 | FGFR2 | HRAS | MAP2K1 | PDGFRA | SMAD4 |
ALK | DDR2 | FGFR3 | IDH1 | MET | PIK3CA | SMARCB1 |
APC | EGFR | FLT3 | IDH2 | MLH1 | PTEN | SMO |
ATM | ERBB2 | FOXL2 | JAK2 | MPL | PTPN11 | SRC |
BRAF | ERBB4 | GNA11 | JAK3 | NOTCH1 | RAC1 | STK11 |
CDH1 | EZH2 | GNAQ | KDR | NPM1 | RB1 | TP53 |
CDKN2A | FBXW7 | GNAS | KIT | NRAS | RET | VHL |
技术参数
建库方法 | 多重PCR扩增技术 |
引物池 | 单管 |
基因/扩增子数目 | 56/251 |
Panel大小 | 24kb(>7200热点突变,6000SNV、1200indels) |
检测类型 | SNV、indels |
平均扩增子长度 | 143bp |
DNA起始量 | 5ng-80ng(10ng推荐) |
样本类型 | 新鲜组织、石蜡组织、血液 |
比对率 | 99.8%±0% |
中靶率 | 96.2%±0.1% |
覆盖均一度 | 96.1%±0.1% |
建库时间 | 低至8小时 |
测序平台 | Illumina and MGISEQ |